SaaS-ohjelmistoa ei perinteisessä mielessä voi räätälöidä kuten omalle palvelimelle asennettavaa järjestelmää. Sen sijaan, että räätälöinti tapahtuisi “purkin sisällä” se tapahtuu “purkin ulkopuolelta” ohjelmointirajapintoja, eli API-rajapintoja hyödyntäen.
Monissa SaaS-ohjelmistoissa on API-rajapinnat, joita kehittäjän on helppo käyttää. Yritys (ja sen IT tai kehittäjät) voivat harsia lukuisista SaaS-ohjelmistoista API-rajapintojen avulla juuri sellaisen järjestelmäkokonaisuuden kuin haluavat.
Useimmiten integraatio tehdään kuitenkin käyttäen joko ohjelmistosta valmiiksi löytyviä integraatioita tai helppokäyttöisiä integraatiopalveluita kuten Zapier, joilla kuka tahansa business-käyttäjä kykenee rakentamaan prosesseja SaaS-ohjelmistojen yli. SaaS-yritykselle on erittäin työlästä luoda ja ylläpitää lukuisia suoria integraatiota toisiin tuotteisiin ja niinpä tänä päivänä panostetaan muutamaan selvästi lisäarvoa tuovaan suoraan integraatioon ja muut sitten Zapierin kautta.
